Харьковский исторический музей (ул. Университетская, 5).
Харьковский художественный музей (ул. Совнаркомовская, 11).
Харьковский литературный музей (ул. Фрунзе, 6).
Харьковский музей природы (ул. Тринклера, 8).
Харьковский частный музей городской усадьбы (как музей не существует, ул. Веснина).
Научно-просветительский музей сексуальных культур мира (ул. Мироносицкая, 81а).
Анатомический музей.
Харьковский морской музей (ул. Совнаркомовская, 13).
Музей археологии при университете.
Музей истории органов внутренних дел.
Музей истории Южной железной дороги (ул. Котлова, 83).
Музей истории пожарной службы Харькова.
Музей городского транспорта.
Музей КП «Вода» (ул. Большая Гончаровская).
Музей «Скорой помощи» (ул. Краснооктябрьская).
Харьковский музей кукол (пл. Конституции, 24).
Музей народного искусства Слобожанщины (ул. Совнаркомоская, 9).
Харьковский музей Холокоста.
Музей-квартира семьи Гризодубовых (пропала в пожаре 2008 г., ул. Мироносицкая, 54а?).
Клуб-музей Клавдии Шульженко (пер. Байкальский, 1).